摩爾達維亞蘇維埃社會主義共和國與整個蘇聯一起參加了第二次世界大戰。

主要打擊來自羅馬尼亞，羅馬尼亞在第三帝國的支持下佔領了比薩拉比亞以及南布格河和德涅斯特河之間的地區。羅馬尼亞人佔領的領土成為大羅馬尼亞的一部分，直到 1944 年在 Jassy-Kishinev 行動期間才歸還給蘇聯的控制——這是偉大衛國戰爭期間蘇聯最成功的行動之一，也是"十大斯大林主義者"之一。罷工"。

它以紅軍部隊的勝利、摩爾達維亞蘇維埃社會主義共和國的解放和德國戰線南翼的徹底失敗而告終。羅馬尼亞站在德國一邊退出戰爭，轉而站在反希特勒聯盟一邊。