La République socialiste soviétique de Moldavie est entrée dans la Seconde Guerre mondiale avec l'ensemble de l'Union soviétique.

Le coup principal lui est tombé de la Roumanie, qui, avec le soutien du Troisième Reich, a occupé la Bessarabie et la région comprise entre le Bug méridional et le Dniestr. Les territoires occupés par les Roumains sont devenus une partie de la Grande Roumanie et ne sont revenus sous le contrôle de l'Union soviétique qu'en 1944 lors de l'opération Jassy-Kishinev - l'une des opérations soviétiques les plus réussies de la Grande Guerre patriotique, l'une des « dix staliniennes grèves".

Elle s'est terminée par la victoire des troupes de l'Armée rouge, la libération de la RSS de Moldavie et la défaite totale de l'aile sud du front allemand. La Roumanie a quitté la guerre aux côtés de l'Allemagne et est passée du côté de la coalition anti-hitlérienne.